Voda obsahující tuhé částice vtéká přívodním potrubím nebo kanálem do vnitřního prostoru filtračního bubnu, nečistoty se zachytávají na vnitřní straně filtrační tkaniny a vyčištěná voda protéká přes tkaninu ven. Při tomto filtračním procesu se celé filtrační zařízení nachází v klidovém stavu (nespotřebovává žádnou energii). Filtrační tkanina se postupně přitékajícími nečistotami ucpává, zvyšuje se odpor plachetky proti protékání a uvnitř bubnu se zvyšuje hladina vody, hydrostatický tlak.
Při dosažení nastavené úrovně hladiny ve vnitřní části filtračního bubnu, hladinová sonda automaticky zapne pohon otáčení bubnu a současně proplachovací čerpadlo, které čerpá přefiltrovanou vodu do trysek proplachovacího systému. Přesně směrovaným proudem vody, vystřikovaným speciálními tryskami, jsou strhávány nečistoty zachycené na vnitřní straně tkaniny do odpadního žlabu, který je umístěn uvnitř bubnu. Kal odtéká do kalové jímky a zde je kalovým čerpadlem, které je také automaticky řízeno hladinovou sondou umístěnou na stěně kalové jímky, odčerpáván ven. Při možnosti gravitačního odtoku kalu je kalové čerpadlo vynecháno. Po ukončení procesu proplachu klesne hladina ve filtračním bubnu a dojde k vypnutí jeho pohonu i čerpadla proplachu. Zařízení je ve stavu klidu. Proces se opakuje.
K zařízení nejsou nutné žádné dodatečné záchytné nádoby pro vodu na zpětný proplach ani pro kalovou vodu, protože při procesu proplachu se přítok surové vody nepřeruší a proplachovací voda se odebírá přímo z filtračního zařízení, což vede ke značnému snížení investičních nákladů. Kalová jímka je integrovanou součástí zařízení.
Automatickým zapínáním a vypínáním filtru se minimalizuje spotřeba el. energie, zvyšuje se průměrná kvalita přefiltrované vody, zvětšuje se hustota odtékajícího kalu a prodlužuje životnost celého zařízení.
V případě nečinnosti mikrosítového filtru vlivem výpadku elektrické energie dojde po čase k naprostému ucpání filtrační tkaniny a voda vystoupá až do výše havarijní hladiny. V tomto případě je voda odváděna přepadem, přičemž zbylá přefiltrovaná voda zůstane čistá. Po odstranění příčiny nečinnosti zařízení lze bez jakéhokoliv zásahu do stroje opět začít filtovat. Proplachovací čerpadlo má dostatek čisté vody k uskutečnění kvalitního proplachu filtrační tkaniny. Zařízení se navrací do původního cyklu.